В годы Великой Отечественной войны Крестовоздвиженский храм оставался единственным действующим храмом в Иркутске, став настоящим духовным центром города.
Здесь возносились молитвы о победе русского воинства, служились панихиды по погибшим воинам, собирались пожертвования в фонд обороны.